Au lieu des traditionnels commutateurs coulissants, la Jaguar signature de Johnny Marr présente un sélecteur de micros spécial de type lame à quatre positions situé sur la corne supérieure. Il permet de sélectionner le micro chevalet seul, les micros chevalet et manche en parallèle, le micro manche seul et les micros manche et chevalet en série.

La Johnny Marr Jaguar présente des inserts spéciaux en nylon pour une meilleure stabilité du chevalet, ainsi qu'un bras de vibrato "plus grand" avec un insert en nylon pour éviter son balancement.

Le vernis nitro-cellulosique est l'une des meilleures finitions employées par Fender sur ses guitares électriques d'époque, et il est toujours utilisé aujourd'hui sur une sélection d'instruments. Fine, poreuse et délicate, cette finition premium est prisée pour ses qualités sonores, puisqu'elle laisse le bois respirer et exprimer son véritable caractère sonore. De même, son vieillissement et son usure très singuliers plaisent à de nombreux guitaristes.

Et pour la touche d'authenticité, le manche sur ce modèle signature présente un confortable profil 'Broken-In" custom (la forme du manche en coupe transversale) directement calquée sur la 1965 Jaguar de Johnny Marr.

Pour des sonorités dignes d'un guitariste aussi inventif et polyvalent, cette Jaguar comprend des micros à simples bobinages "Bare Knuckle" Johnny Marr bobinés spécialement en positions manche et chevalet.

La Johnny Marr Jaguar présente un élément de design très spécial : deux commutateurs coulissants sont installés sur la corne supérieure — l'un est un commutateur de brillance "universel" qui booste le tout, tandis qu'un commutateur de brillance séparé n'affecte que la position de micros "en série".